Hotel usytuowany jest około 4 km od zabytkowego centrum Starego Miasta. Lokalizacja hotelu w zacisznej okolicy z dala od wielkomiejskiego zgiełku stwarza dogodne warunki do pracy i wypoczynku. Położenie w dzielnicy Podgórze umożliwia dogodny dojazd do centrum starego miasta, Parku Wodnego oraz wyjazd w kierunku Wieliczki, Zakopanego i Oświęcimia.
Przy hotelu znajduje się parking monitorowany dla autokarów i samochodów osobowych (samochody osobowe bezpłatnie). W przypadku autokarów wymagana jest wcześniejsza rezerwacja miejsca.

Hotel Junior Krakus oferuje noclegi w pokojach 1, 2, 3 osobowych z osobnymi łazienkami oraz w pokojach studio.